贡嘎山地势高低悬殊，自下而上处于亚热带、暖温带、寒温带、亚寒带、寒带、寒冷带、冰雪带7个气候区，特定的地理环境和特殊的气候条件，形成了多层次的立体植物带和特有的自然景观。海拔5000米以上的山峰，终年积雪；低海拔、无人烟的坡麓地带森林密布，郁郁葱葱，生态环境原始，森林受人类活动的影响小，植被完整，几乎拥有从亚热带到高山寒带能生存的所有植物物种。珍稀植物种类繁多，拥有植物4880余种，属国家保护的珍稀物种达400余种，东部河谷地区还遗留了不少被称为“活化石”的古老的动植物。而栖息在这里的野生动物达400余种，珍稀保护动物有28种，堪称世界野生动、植物的大观园。
木格措
冰山湖泊星罗棋布，10多个高原湖泊分布于景区内。著名的有木格错、五须海、人中海、巴旺海等，或在冰川脚下，或为森林环抱，水色清澈透明，保持着原始、秀丽的自然风貌，仿若“瑶池仙境”。